Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VOPP1Q96AW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VOPP1Q96AW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms