Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102AQ96A19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC102AQ96A19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC102AQ96A19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102AQ96A19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms