Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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TRIM63Q969Q1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TRIM63Q969Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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