Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2FQ969M7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2FQ969M7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2FQ969M7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms