Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM54Q969K7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM54Q969K7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM54Q969K7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms