Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF34Q969K3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms