Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BHMTQ93088 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMTQ93088 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms