Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFRSF25Q93038 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFRSF25Q93038 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms