Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP13Q92995 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP13Q92995 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP13Q92995 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP13Q92995 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP13Q92995 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP13Q92995 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP13Q92995 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP13Q92995 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP13Q92995 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP13Q92995 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP13Q92995 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP13Q92995 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP13Q92995 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP13Q92995 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP13Q92995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP13Q92995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP13Q92995 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms