Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RORBQ92753 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RORBQ92753 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RORBQ92753 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RORBQ92753 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORBQ92753 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORBQ92753 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RORBQ92753 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RORBQ92753 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RORBQ92753 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RORBQ92753 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms