Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNQ92622 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUBCNQ92622 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUBCNQ92622 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms