Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM1Q92611 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM1Q92611 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM1Q92611 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms