Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXX5

DNAJC9, DnaJ homolog subfamily C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC9Q8WXX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC9Q8WXX5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC9Q8WXX5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC9Q8WXX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC9Q8WXX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC9Q8WXX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms