Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOCS4Q8WXH5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOCS4Q8WXH5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOCS4Q8WXH5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOCS4Q8WXH5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOCS4Q8WXH5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOCS4Q8WXH5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms