Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAT3Q8TDW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAT3Q8TDW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT3Q8TDW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
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