Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPBAR1Q8TDU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPBAR1Q8TDU6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.2 ms