Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNIH3Q8TBE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNIH3Q8TBE1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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