Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1Q8TAE8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms