Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms