Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFWD2Q8NHY2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD2Q8NHY2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms