Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEST2Q8NFU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms