Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR7Q8N806 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBR7Q8N806 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms