Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZCCHC9Q8N567 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms