Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD4Q8IYR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD4Q8IYR2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms