Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29P2Q8IUI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29P2Q8IUI4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX29P2Q8IUI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX29P2Q8IUI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms