Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALB2Q86YC2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALB2Q86YC2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALB2Q86YC2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms