Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETREG3Q86VR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms