Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACS2Q86VP3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACS2Q86VP3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms