Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS12Q6ZW61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms