Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPOCD1Q6ZMY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPOCD1Q6ZMY3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPOCD1Q6ZMY3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms