Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LBX2Q6XYB7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LBX2Q6XYB7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LBX2Q6XYB7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LBX2Q6XYB7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms