Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG3Q6UXM1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRIG3Q6UXM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms