Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARM1Q6SZW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARM1Q6SZW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms