Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC41PQ6P2S7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC41PQ6P2S7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms