Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF6Q6KF10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDF6Q6KF10 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GDF6Q6KF10 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms