Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RALGAPA1Q6GYQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RALGAPA1Q6GYQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms