Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTC19Q6DKK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC19Q6DKK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC19Q6DKK2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms