Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLFN13Q68D06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLFN13Q68D06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms