Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QL3Q5VWW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms