Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC38Q5VT99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC38Q5VT99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms