Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
OBSCNQ5VST9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms