Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOGA3Q5TF21 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOGA3Q5TF21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms