Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms