Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SAMD4BQ5PRF9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4BQ5PRF9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms