Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms