Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2CQ496J9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2CQ496J9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms