Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT71Q3SY84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms