Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q1T7F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q1T7F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q1T7F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q1T7F1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q1T7F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q1T7F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q1T7F1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q1T7F1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q1T7F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q1T7F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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