Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPP1Q16831 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPP1Q16831 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.9 ms