Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FOXD1Q16676 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXD1Q16676 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
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